Science新线索：疫情发源地或“易主”？

Science新线索：疫情发源地或“易主”？

截止到1月28日 07:22，中国（含港澳台）已确诊4529例，死亡106例，治愈62例。

新型冠状病毒在全球范围内的确诊病例数以令人担忧的速度激增。那个人尽皆知的华南海鲜市场位于武汉市江汉区的闹市区，距汉口火车站不足一公里，虽名为“海鲜市场”，但里面也能买到禽类、野味等食材，此前一直被认为是此次新型冠状病毒疫情的起源地。

中国疾控中心病毒病所1月26日称，从华南海鲜市场的585份环境样本中，检测到33份样品含有新型冠状病毒核酸，并成功在阳性环境标本中分离病毒，提示该病毒来源于华南海鲜市场销售的野生动物。

中国疾控中心披露的报告显示，这些阳性样本分布在市场上的22个摊位和1个垃圾车。

上周五发表在《柳叶刀》上对首批临床病例的描述，对华南海鲜市场是疫情起源地的假设提出了挑战。

该论文由来自中国多家学术机构的研究人员撰写，提供了有关首批41例确诊感染新型冠状病毒（2019-nCoV）住院患者的详细信息。作者报告说，最早的病例于12月1日发病，没有报道与海鲜市场有联系。在第一个病人和后来的病例之间没有发现流行病学上的联系。

他们的数据还显示，在这41个病例中，有13例与华南海鲜市场无关。美国乔治城大学的传染病学家Daniel Lucey说：“竟然有13例无关联，这一比例很大。”

中国国家卫生健康委员会和世界卫生组织早些时候的报告称，第一例患者于12月8日出现症状，而这些报告只是说，“大多数”病例与1月1日关闭的海鲜市场有关。

Lucey认为，如果新的数据是准确的，那么第一批人类感染肯定发生在11月（或更早），因为在感染和症状出现之间有一个潜伏期。如果是这样的话，该病毒可能会在武汉和其他地方的人与人之间悄然传播，直到去年12月下旬，在华南海鲜批 发市场才发现了这批病例。Lucey断言：“病毒是先进入了市场，然后从那里传播出去的”。

Lucey说，《柳叶刀》那篇论文的数据也对初始信息的准确性提出了质疑。在疫情爆发之初，官方主要的信息来源是武汉市卫健委1月11日的通知。

美国圣地亚哥斯克里普斯研究所的进化生物学家Kristian Anderson分析了新型冠状病毒（2019-nCoV）的序列，以试图弄清它的起源。他说：“有人在市场以外被感染，然后把病毒带到市场，这是我们考虑过的三种情况之一。我们的数据也与此一致。根据我们目前的数据和知识，这是完全合理的。另外两种情况是，源头是一群受感染的动物，或者是进入市场的一只动物。”

Anderson于1月25日在病毒学研究网站上发表了他对2019-nCoV的27个可用基因组的分析，表明它们早在10月1日就有一个“最近的共同祖先”，即一个共同的来源。

Phylogenetic Tree 图片来源：virological.org

《柳叶刀》那篇论文的通讯作者、北京首都医科大学肺病专家曹斌在给ScienceInsider的电子邮件中写道：“现在看来，很明显，海鲜市场并不是该病毒的唯一来源。但说实话，我们现在还不知道病毒是从哪里来的。”

Lucey指出，2012年6月，MERS病毒一开始发现在一个沙特阿拉伯患者身上，但后来的研究将其追溯到同年4月在约旦医院爆发的不明原因肺炎。约旦两名死者的样本证实他们感染了该病毒。他认为，对中国人和动物，包括来自其他动物市场商贩的血液样本进行回顾性分析，可能会清楚地揭示2019-nCoV的起源。他表示，一个明确的信息或能浮出水面。

香港中文大学流行病学教授唐金陵评论说：“华南海鲜市场当时应该存在病毒的多点来源，而且它们之间比较分散，几十个病人又在短期内同时出现，且有没有彼此接触的历史，说明感染的野生动物可能不是偶然性地进入了一家摊位，而是短期内同时进入了多家门店，这样才可能同时引起这么多人发病。”

基于以上推测，唐教授认为，该病毒在野生动物传染源里可能已经比较常见，这就增加了这些动物进入其他市场或再次进入市场，进而感染人类的可能性。

唐教授说：“最初的发源地可能不是一个点，而是一大片，而且有人传人的可能性。扑灭疫情最初没做最坏的打算。考虑到初期感染者有部分没有华南海鲜市场接触史和感染者密切接触史，除华南海鲜市场外，还需考虑武汉其他市场有无病毒检出，探明‘一大片’的范围究竟有多大，以最终彻底切断动物再传染人类的机会。”

唐金陵也强调，这些推测是基于目前有限的数据，正确与否需要进一步调查验证。

参考文献：

1. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China

DOI:10.1016/S0140-6736(20)30183-5

2. Clock and TMRCA based on 27 genomes

http://virological.org/t/clock-and-tmrca-based-on-27-genomes/347

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